1974年7月15日，經國家文物局批準，袁仲一帶隊開啟了秦始皇陵秦俑考古之旅。回憶起在陜西幾十年的考古發掘歷程，袁仲一說，一首《長相思·懷念老考古隊員》可道盡個中甘苦：“一把鏟，一條繩，尋幽探秘驪山陵。朝朝暮暮情。腰如弓，鏟聲聲，奇珍異寶一宗宗。誰知精血凝。”

以實證推翻舊說

袁仲一是20世紀60年代中期畢業的歷史學研究生，畢業后他主動要求到西部工作。這種人生選擇，在袁仲一的工作和生活中已經成為一種不經意的習慣。發掘兵馬俑、勘探始皇陵、研究秦俑學、探索秦文化……袁仲一的為學腳步穩健扎實，他以浩繁的史料為基礎，復原被舊說遮蔽的秦文化之光。

傳統觀念認為，佛教傳入中國后，中國雕塑藝術才發展起來。袁仲一提出，秦始皇陵發現的一號、二號、三號兵馬俑坑中，有陶俑8000多件，其千人千面、千姿百態，既注重寫實又不照搬現實，而是將人物形象的實際面貌與藝術創作的理想性表現性相結合，這是在佛教傳入之前就已經形成的雕塑藝術風格。

樂府起源于漢代的觀點，自顏師古以來就已成為定論。1976年，袁仲一意外發現的秦樂府編鐘則推翻了這一舊說。袁仲一說，關于這一事件的正確表述應為，漢武帝設立了利用樂府采詩的制度，而秦代則早已有了樂府機構。他強調，秦樂府編鐘并非孤證，1976年出土于西安北郊的一批秦封泥中，有“樂府”封泥1品、“秦樂府丞”封泥22品，而國外相關著錄中亦有相關史料。

自1992年起，袁仲一曾多年擔任陜西省司馬遷研究會會長，他以弘揚司馬遷精神為己任。在他與其他學者的組織下，研究會多次舉辦國際學術研討會，出版了《司馬遷與史記論集》、《司馬遷與華夏文化系列叢書》，還組織編纂大型學術工程《史記研究集成》。

考古事業也要知其所止，袁仲一說，“我不主張挖秦始皇陵”。在他看來，不主動發掘是國內外考古界慣例，長處地下恒溫恒濕狀態幾千年的文物出土后如何保護，依然是世界性難題。不能因為考古工作者 “圖自己好奇”，就開掘陵墓。