學科交叉與融合是兩個有緊密關(guān)聯(lián)而側(cè)重點又有一定區(qū)別的概念。

　　交叉，主要指匯集。如各種方法、各種資料、各種技術(shù)在同一個問題研究中分別使用，最終將它們的能力與作用匯集在一起。“匯”從“水”，更似水流聚集。因此更多的是在物理層次、量變層次上的匯集。廣西著名的邕江，由左江、右江等三條河聚集而成，所以邕字頭上三江水，“邕”在壯語中的意思就是匯集。這實際上就是系統(tǒng)科學中的“集成”思想。

　　融合，更強調(diào)相互滲透，合為一體。而“一體”后的事物，既不是融合前原來的“這個”，也不是原來的“那個”，而是產(chǎn)生了“非此非彼”又“即此即彼”的新內(nèi)涵。例如，生命科學中的細胞融合（Cell Fusion），又稱細胞雜交（Cell Hybridization），就是指兩個或多個細胞相互滲透，結(jié)合成一個新細胞的現(xiàn)象。體外動物細胞的融合，多用一些誘導(dǎo)物質(zhì)來制得一種新品系的雜交細胞（Hybrid Cell），而這種雜交細胞一般具有很強的生命力，增殖旺盛，這就是融合的意義所在。所以，融合更多的是在化學層次、生命層次、質(zhì)變層次上的結(jié)合。這就是系統(tǒng)科學中的“綜合”思想。

　　在社會科學領(lǐng)域，對社會現(xiàn)象及其規(guī)律的研究，既包括宏觀問題，也包括微觀問題；既包含結(jié)構(gòu)性問題，也包含非結(jié)構(gòu)性問題；既包含可定量的問題，也包含難以定量的定性問題；即使一個領(lǐng)域的同一類問題，也有研究目的不同、研究視角不同、研究者學術(shù)偏好不同的差異性，因此，在社會科學研究中，不能只依一個理念、從一種角度、用一種方法、使一種工具就能解決問題，特別是當前我們一般遇到的都是較為復(fù)雜的社會現(xiàn)象與問題，這就更需要我們在研究社會科學問題時，把社會科學、自然科學與人文科學相結(jié)合、科學理論與實際經(jīng)驗相結(jié)合、定性與定量相結(jié)合、人與計算機相結(jié)合，并使這些結(jié)合相互滲透、合為一體、即形成融合，融合不僅能涌現(xiàn)出新的前所未有的研究能力，還能涌現(xiàn)出前所未有新的學科分支與學科領(lǐng)域。

　　由此可見，社會科學研究既要運用學科交叉又要運用學科融合，這在系統(tǒng)科學思想中，就是既要集成，又要綜合，還需要在集成之上綜合，在綜合之上集成，即所謂運用綜合集成思想。

　　眾所周知，系統(tǒng)科學中的綜合集成思想是我國以錢學森為首的系統(tǒng)科學家歷經(jīng)幾十年探索提出的認識、研究和處理復(fù)雜系統(tǒng)問題、體現(xiàn)東方哲學智慧與文化特征的方法論。社會系統(tǒng)是典型的復(fù)雜巨系統(tǒng)，因此，學科交叉與融合自然應(yīng)該成為社會科學研究具有重要指導(dǎo)意義方法論原則。

　　十多年前，我們在研究工作中不斷發(fā)現(xiàn)，所研究的社會經(jīng)濟問題日趨復(fù)雜，如重大工程管理問題不僅涉及到工程技術(shù)，而且涉及到社會、經(jīng)濟、環(huán)境與人文領(lǐng)域，干系人不僅有政府、企業(yè)，而且關(guān)系到數(shù)量巨大的公眾，因此，常因問題變量多、隨機性強以及要素關(guān)聯(lián)復(fù)雜而無法建立問題的數(shù)學模型，至于單純的定性方法更缺乏分析問題的深刻性與精細化，這在很大程度上反映了傳統(tǒng)的社會科學研究方法在復(fù)雜社會問題面前的“窘迫性”。

　　從2001年起，我們開始運用以復(fù)雜系統(tǒng)為基本理論，綜合博弈論、運籌學和統(tǒng)計分析等數(shù)學方法、人工社會、元胞自動機、多主體系統(tǒng)、心理學、行為科學、文化基因等多學科交叉的計算實驗方法開展對復(fù)雜社會系統(tǒng)多要素行為、宏微觀層次之間相互影響以及系統(tǒng)整體狀態(tài)演化規(guī)律的研究，研究領(lǐng)域涉及到經(jīng)濟系統(tǒng)演化、公共管理、環(huán)境綜合治理、重大工程管理等，取得了一定的成功。2006年，南京大學從“大社科”理念出發(fā)，正式成立了“南京大學社會科學計算實驗中心”，并提供了專門的經(jīng)費及其他資源，保證了中心的正常運轉(zhuǎn)和持續(xù)發(fā)展。中心的學術(shù)指導(dǎo)思想為“綜合性、開放式、創(chuàng)新性、國際化”。僅2008年以來，中心就先后承擔了國家社科基金重大項目、國家自然科學基金重點項目、國家科技支撐計劃項目等，在《上海三聯(lián)書店》出版社、《科學出版社》出版了一批學術(shù)著作，在國際學術(shù)刊物上發(fā)表了數(shù)十篇學術(shù)論文，獲得教育部科技進步一等獎，取得了較好的研究成果。目前，除南大幾個社科類學院外，還有江蘇四五所高校的研究人員以該中心為平臺，合作開展社會科學跨學科研究，較好地體現(xiàn)了跨地區(qū)、跨單位和跨學科的綜合優(yōu)勢。